تایپینگ مولکولی جدایه های کاندیدا آلبیکنس جدا شده از حیوانات بر اساس شناسایی توالی های تکراری با استفاده از آغاز گر های اختصاصی alt

اکثر عفونتهای قارچی درانسان توسط گونه های کاندیدا ایجاد میشود. در حیوانات نیز گونه های کاندیدا از مهمترین عوامل ایجاد بیماری های مخاطی و جلدی و در پاره موارد عفونتهای سیستمیک هستند. همچنین کاندیدا آلبیکنس در بین گونه های کاندیدا شایعترین گونه شناخته شده است. تایپینگ استرین ها وتعیین گونه برای درک زیست شناسی، همه گیرشناسی و تعیین ساختار جمعیتی، پیشگیری و درمان آنها ضروری است. در این بین توالی های های نوکلئوتیدی در رونوشت های داخلی توالی های تکراری (rps)، در کاندیدا آلبیکنس altsنامیده می شود. این توالی ها مبنایی برای تعیین تنوع ژنتیکی در کاندیدا آلبیکنس می باشند و بر این اساس کاندیدا آلبیکنس را گروه بندی می کنند. 27 نمونه کاندیدای جدا شده از حیوانات، شامل نمونه های جدا شده از مخاط دهان، پوست و واژن سگ، گربه و اسب، گاو و پرندگان جمع آوری گردید. در ابتدا پس از تشخیص اولیه با روشهای فنوتیپی، به منظور تایید استرین ها و شناسایی قطعی سویه های بالینی مورد مطالعه و جداسازی گونه های کاندیدا آلبیکنس، از یک واکنش pcr-rflp استفاده گردید. پس از استخراج dna، واکنش pcr با استفاده از جفت آغازگرits4-its1 انجام گرفت. سپس تعیین الگوی هضم آنزیمی محصولات pcr با استفاده از آنزیم msp1 انجام شد و محصولات واکنش هضم آنزیمی الکتروفورز شدند و بر اساس الگوی باند تشکیل شده مورد شناسایی قرار گرفتند. در مرحله بعدی واکنش pcr بمنظور تعیین نوع 25s rdna و تکثیر نواحی rpsبا پرایمر های asdcfوpcscr انجام گرفت. پس از انجام واکنش برای بدست آوردن الگوی قطعات تکثیر یافته مورد نظر، محصول pcr بر روی ژل آگارز بررسی گردید. بر اساس تایپینگ 25srdnaچهار ژنوتایپ کاندیدا آلبیکنس بدست آمد که عبارتند از a, b, c, e. در نمونه های مورد مطالعه بیشترین شیوع متعلق به ژنوتایپ a(40.7%) و پس از آن ژنوتایپ e در جایگاه دوم و در نهایت ژنوتیپ های b و c با درصد مشابه در جایگاه سوم قرار داشتند. بر طبق نتایج تایپینگ بر اساس ترکیب روش abc تایپینگ و تکثیر نواحیrps/alt،13 ژنوتایپ کاندیدا آلبیکنس در 27 جدایه مورد مطالعه بدست آمد. در نمونه های مورد مطالعه ژنوتیپ a3(14%) و پس از آن ژنوتایپ های a3/4، b3، c3 و e3/4شایع تر بوده است. بحث و نتیجه گیری برخی ژنوتایپ های جدا شده از حیوان مشخص گردید. نتایج نشان می دهند که جمعیت کاندیدا آلبیکنس جدا شده از حیوانات، جمعیتی هتروژن با تنوع نسبی است و همچنین سیستم ترکیبی25s rdna/rps در تایپینگ مولکولی کاندیدا آلبیکنس کارایی دارد. هیچ ارتباط مشخصی بین ژنوتایپ ها ومیزبان حیوانی بدست نیامد و ژنوتایپ ها متفاوت از آنچه در مطالعات انسانی بدست آمده، نبودند.